Scanwatt arbeider i hovedsak på to områder: Fornybar og miljøvennlig teknologi samt klimavennlig drivstoff for dieselmotorer, som er særlig aktuelt for Grønt skipsfartsprogram.
Scanwatt har som mål å etablere produksjon av biometanol og biodiesel i Norge, basert på biomaterialer som skogsavfall, biomasse og restavfall fra landbruk, fiskeoppdrett og husholdning.